El Club Futbol Sala Molins 99 va ser fundat el maig de 1999 per un grup de joves amb la intenció que tots els practicants d’aquest esport tinguessin un club de referència a Molins de Rei. La idea era crear una escola de futbol sala i formar jugadors des de petits perquè poguessin anar competint en totes les categories fins arribar a sénior.

El primer president del club va ser Josep Mª Juarros i després el van succeïr en Jesús González i l’actual president, Jaume Solé. Amb el pas dels anys i en consonància amb el creixement del club la Junta Directiva també ha anat augmentant i actualment està formada per deu persones, algunes de les quals són socis fundadors del club i a les que s’han anat afegint noves incorporacions.

Des de l’any 2001 els equips del CFS Molins 99 disputen competicions federades. Actualment el club compta amb un sénior masculí a Primera Divisió Catalana. Des de la temporada 2006-07 també hi ha equips femenins i enguany comptem amb un juvenil femení a més de jugadores en categories inferiors.

A part del sénior el CFS Molins 99 compta, pel que fa a les categories masculines, amb un equip juvenil, un cadet, dos infantils i dos alevins que també disputen competicions federades. Un altre equip aleví i dos de benjamins juguen la competició del Consell Escolar del Baix Llobregat. En total, doncs, el club compta amb onze equips i més de 130 esportistes.

A finals de l’any 2009 es produeix el trasllat dels equips al Poliesportiu La Sínia, que esperem que sigui la seu de molts èxits per a l’entitat.

El CFS Molins 99 també organitza activitats durant l’any, com els tornejos en acabar la temporada o el 4x4 al carrer a l’Esportíssim, a més de la participació a la Fira d’Entitats de la Fira de la Candelera.